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    转录组学的新方法揭示了稳态和急性**炎中的细胞景观

    行业新闻
    来源:原创 2024-08-27 17:47:41 9

    急性**炎(AP)是一种**组织的急性炎症,其特征是**组织自噬、水肿和坏死。腺泡细胞主导**的外分泌部,其产生的消化酶在生理和病理过程中扮演着关键角色。然而,由于腺泡细胞中高浓度的核酸酶和蛋白酶,传统的单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)在**研究中的应用受到了限制,导致对**细胞异质性的全面认识不足。                                  

    2024年6月,《Gastroenterology》杂志发表了一篇题为《Novel Approach for Pancreas Transcriptomics Reveals the Cellular Landscape in Homeostasis and Acute Pancreatitis》的文章,为这一领域带来了突破性进展。


    该研究通过创新FixNCut单细胞RNA测序技术,成功揭示了**在稳态和急性**炎状态下的细胞异质性。在急性**炎模型中,观察到所有主要细胞类型的显著转录变化,这为理解**炎的细胞和分子机制提供了新的视角。

    FixNCut 实现了对具有挑战性的**细胞的前所未有的定义,包括稳态和急性**炎中的腺泡和免疫群体,并识别损伤和恢复期间所有主要细胞类型的变化。该项研究定义了稳态和腺泡到导管化生期间的腺泡转录组,并建立了一个独特的基因集来测量与正常腺泡身份的偏差。通过对**免疫细胞进行表征分析T细胞亚群,揭示了稳态**向Ⅱ 型免疫的极化。同时,该研究报告了急性**炎和恢复期间的免疫反应,包括早期中性粒细胞浸润、树突状细胞亚群的扩增以及由于驻留巨噬细胞活化和单核细胞浸润导致的巨噬细胞转录组的重大转变。

                                               

     

    FixNCut技术,提高了RNA的质量和测序的深度,减少了技术假象,使得研究结果更为精确。为**疾病的细胞异质性和动态变化提供更全面的视角,这对于理解**炎的发病机制和探索新的治疗策略具有重要意义。此外,本研究还建立了一个基于基因签名的腺泡细胞到ADMI,为量化腺泡细胞从正常状态偏离的程度提供了一个客观的标准,这在**疾病研究中尚属首次。该研究加深了对**细胞在健康和疾病状态下的理解,也为未来的生物标志物发现和治疗策略的开发奠定了基础。


    原文链接:https://doi.org/10.1053/j.gastro.2024.01.043


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