染色质免疫沉淀技术( ChIP)
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实验原理
染色质免疫沉淀技术是研究体内蛋白质与DNA相互作用的方法。ChIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。其原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,进行片段化处理后形成染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集与目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA 相互作用的信息。
应用
ChIP 与其他方法的结合,扩大了其应用范围:ChIP 与基因芯片相结合建立的 ChIP-on-Chip 方法已广泛用于特定反式因子靶基因的高通量筛选;CHIP与体内足迹法相结合,用于寻找反式因子的体内结合位点;RNA-ChIP 用于研究 RNA 在基因表达调控中的作用。
案例展示
参考文献:Holly H ,Amanda K ,Alexander S .Chromatin immunoprecipitation of transcription factors and histone modifications in Comma-Dβ mammary epithelial cells.[J].STAR protocols,2021,2(2):100514-100514.DOI: 10.1016/J.XPRO.2021.100514