Pull-down
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实验原理
标签蛋白-Pull down原理:将靶蛋白-GST 融合蛋白亲和固化在谷胱甘肽亲和树脂上,作为与目的蛋白亲和的支撑物,充当一种“诱饵蛋白”,目的蛋白溶液过柱,可从中捕获与之相互作用的“捕获蛋白”(目的蛋白),洗脱结合物通过 SDS-PAGE 电泳分离,最后经western blot或质谱分析,从而证实两种蛋白间的相互作用;
DNA/RNA-Pull down原理:首先对DNA以及RNA探针进行生物素标记 ,然后将其与细胞裂解液共同孵育,形成 DNA/RNA-蛋白质复合物,分离复合物得到蛋白质,通过蛋白免疫印迹(western blot)检测蛋白质互作或质谱(massspectrometry)预测互作蛋白。
检测方法
Pull down分为DNA Pull down 、RNA Pull down以及标签蛋白的Pull down(GST-pull down、MBP-Pull down )等。
优点
1. 可鉴别直接互作的蛋白;
2. 融合标签(GST、MBP)后的蛋白,纯化效率高;
3. 将一些难溶性蛋白变为可溶性蛋白,降低互作蛋白实验难度。
应用
可用于检测DNA与蛋白质、RNA与蛋白质、以及蛋白质与蛋白质在体外的互作关系,同时也可用于DNA、RNA、蛋白质等诱饵的互作蛋白鉴定。
案例展示
参考文献:1. Oleg S ,Alyona K ,Alexey P , et al.SEMG1/2 augment energy metabolism of tumor cells.[J].Cell death & disease,2020,11(12):1047-1047. DOI: 10.1038/S41419-020-03251-W;
2. Netnapa C ,Uraipan S ,Monwadee W , et al. Effect of the interaction between ribosomal protein L10a and insulin receptor on carbohydrate metabolism[J]. Heliyon,2020,6(12): DOI:https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2020.e05714;